Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trpc3Q9QZC1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc3Q9QZC1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc3Q9QZC1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms