Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Six6Q9QZ28 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Six6Q9QZ28 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Six6Q9QZ28 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms