Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SpastQ9QYY8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SpastQ9QYY8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.8 ms