Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nufip1Q9QXX8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nufip1Q9QXX8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nufip1Q9QXX8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.4 ms