Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dkk3Q9QUN9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dkk3Q9QUN9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dkk3Q9QUN9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Dkk3Q9QUN9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dkk3Q9QUN9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dkk3Q9QUN9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dkk3Q9QUN9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dkk3Q9QUN9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dkk3Q9QUN9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Dkk3Q9QUN9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dkk3Q9QUN9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Dkk3Q9QUN9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms