Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms