Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms