Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dclk1Q9JLM8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dclk1Q9JLM8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Dclk1Q9JLM8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Dclk1Q9JLM8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dclk1Q9JLM8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dclk1Q9JLM8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dclk1Q9JLM8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dclk1Q9JLM8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dclk1Q9JLM8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dclk1Q9JLM8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Dclk1Q9JLM8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dclk1Q9JLM8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dclk1Q9JLM8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dclk1Q9JLM8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dclk1Q9JLM8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dclk1Q9JLM8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms