Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col5a3Q9JLI2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col5a3Q9JLI2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col5a3Q9JLI2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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