Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AatfQ9JKX4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AatfQ9JKX4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AatfQ9JKX4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AatfQ9JKX4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AatfQ9JKX4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AatfQ9JKX4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AatfQ9JKX4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AatfQ9JKX4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AatfQ9JKX4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AatfQ9JKX4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AatfQ9JKX4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms