Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bgrlQ9JJU8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bgrlQ9JJU8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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