Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl28Q9JIL2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.8 ms