Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX5

Dkc1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkc1Q9ESX5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dkc1Q9ESX5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dkc1Q9ESX5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dkc1Q9ESX5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dkc1Q9ESX5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms