Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ubiad1Q9DC60 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubiad1Q9DC60 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubiad1Q9DC60 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms