Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SrpraQ9DBG7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrpraQ9DBG7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SrpraQ9DBG7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SrpraQ9DBG7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SrpraQ9DBG7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms