Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Subh2bvQ9D9Z7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Subh2bvQ9D9Z7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Subh2bvQ9D9Z7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Subh2bvQ9D9Z7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Subh2bvQ9D9Z7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Subh2bvQ9D9Z7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Subh2bvQ9D9Z7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms