Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lin37Q9D8N6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lin37Q9D8N6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms