Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Alkbh4Q9D8F1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms