Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpl4Q9D8E6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl4Q9D8E6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms