Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slx4ipQ9D7Y9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slx4ipQ9D7Y9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slx4ipQ9D7Y9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx4ipQ9D7Y9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms