Protein–RNA interactions for Protein: Q9D753

Exosc8, Exosome complex component RRP43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc8Q9D753 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Exosc8Q9D753 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Exosc8Q9D753 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms