Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tube1Q9D6T1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tube1Q9D6T1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms