Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc105Q9D4K7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc105Q9D4K7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc105Q9D4K7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms