Protein–RNA interactions for Protein: Q9D496

4930548H24Rik, RIKEN cDNA 4930548H24, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930548H24RikQ9D496 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930548H24RikQ9D496 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930548H24RikQ9D496 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930548H24RikQ9D496 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930548H24RikQ9D496 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930548H24RikQ9D496 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930548H24RikQ9D496 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930548H24RikQ9D496 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930548H24RikQ9D496 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930548H24RikQ9D496 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930548H24RikQ9D496 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930548H24RikQ9D496 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930548H24RikQ9D496 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930548H24RikQ9D496 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930548H24RikQ9D496 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930548H24RikQ9D496 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930548H24RikQ9D496 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930548H24RikQ9D496 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930548H24RikQ9D496 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930548H24RikQ9D496 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930548H24RikQ9D496 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930548H24RikQ9D496 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930548H24RikQ9D496 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4930548H24RikQ9D496 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930548H24RikQ9D496 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
4930548H24RikQ9D496 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930548H24RikQ9D496 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930548H24RikQ9D496 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930548H24RikQ9D496 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930548H24RikQ9D496 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930548H24RikQ9D496 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930548H24RikQ9D496 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930548H24RikQ9D496 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930548H24RikQ9D496 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930548H24RikQ9D496 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930548H24RikQ9D496 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930548H24RikQ9D496 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930548H24RikQ9D496 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930548H24RikQ9D496 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930548H24RikQ9D496 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
4930548H24RikQ9D496 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930548H24RikQ9D496 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
4930548H24RikQ9D496 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930548H24RikQ9D496 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930548H24RikQ9D496 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930548H24RikQ9D496 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
4930548H24RikQ9D496 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms