Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V5

Fsip1, Fibrous sheath-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fsip1Q9D3V5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fsip1Q9D3V5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fsip1Q9D3V5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms