Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pramef12Q9D2F1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramef12Q9D2F1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pramef12Q9D2F1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms