Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1R9

Rpl34, 60S ribosomal protein L34, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl34Q9D1R9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl34Q9D1R9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpl34Q9D1R9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl34Q9D1R9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms