Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SarnpQ9D1J3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SarnpQ9D1J3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms