Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syf2Q9D198 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syf2Q9D198 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Syf2Q9D198 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms