Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Tmem53Q9D0Z3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tmem53Q9D0Z3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem53Q9D0Z3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 547 ms