Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B0

Srsf9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf9Q9D0B0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srsf9Q9D0B0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf9Q9D0B0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf9Q9D0B0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf9Q9D0B0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf9Q9D0B0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf9Q9D0B0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf9Q9D0B0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf9Q9D0B0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf9Q9D0B0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf9Q9D0B0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf9Q9D0B0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf9Q9D0B0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf9Q9D0B0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf9Q9D0B0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf9Q9D0B0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf9Q9D0B0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf9Q9D0B0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf9Q9D0B0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf9Q9D0B0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms