Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.1 ms