Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mis18aQ9CZJ6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mis18aQ9CZJ6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mis18aQ9CZJ6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms