Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYD3

Crtap, Cartilage-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrtapQ9CYD3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrtapQ9CYD3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrtapQ9CYD3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrtapQ9CYD3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrtapQ9CYD3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrtapQ9CYD3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrtapQ9CYD3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrtapQ9CYD3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrtapQ9CYD3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrtapQ9CYD3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrtapQ9CYD3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CrtapQ9CYD3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CrtapQ9CYD3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrtapQ9CYD3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.4 ms