Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc8Q9CYA6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Zcchc8Q9CYA6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms