Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm8Q9CXT6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm8Q9CXT6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm8Q9CXT6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm8Q9CXT6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm8Q9CXT6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm8Q9CXT6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm8Q9CXT6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm8Q9CXT6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm8Q9CXT6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm8Q9CXT6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm8Q9CXT6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm8Q9CXT6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm8Q9CXT6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm8Q9CXT6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm8Q9CXT6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm8Q9CXT6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm8Q9CXT6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm8Q9CXT6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm8Q9CXT6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm8Q9CXT6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm8Q9CXT6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm8Q9CXT6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm8Q9CXT6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm8Q9CXT6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm8Q9CXT6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm8Q9CXT6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms