Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp23Q9CX11 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp23Q9CX11 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms