Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ly6kQ9CWP4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ly6kQ9CWP4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ly6kQ9CWP4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms