Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU24

Themis3, Protein THEMIS3, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Themis3Q9CU24 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Themis3Q9CU24 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Themis3Q9CU24 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Themis3Q9CU24 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Themis3Q9CU24 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Themis3Q9CU24 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Themis3Q9CU24 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Themis3Q9CU24 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Themis3Q9CU24 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Themis3Q9CU24 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Themis3Q9CU24 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Themis3Q9CU24 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Themis3Q9CU24 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Themis3Q9CU24 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Themis3Q9CU24 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Themis3Q9CU24 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Themis3Q9CU24 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Themis3Q9CU24 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Themis3Q9CU24 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Themis3Q9CU24 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Themis3Q9CU24 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Themis3Q9CU24 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms