Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sft2d3Q9CSV6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sft2d3Q9CSV6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms