Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mid1ip1Q9CQ20 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms