Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim12aQ99PQ1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim12aQ99PQ1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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