Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bco2Q99NF1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
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