Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpgs1Q99MS8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpgs1Q99MS8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tpgs1Q99MS8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpgs1Q99MS8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpgs1Q99MS8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpgs1Q99MS8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpgs1Q99MS8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tpgs1Q99MS8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpgs1Q99MS8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpgs1Q99MS8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpgs1Q99MS8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpgs1Q99MS8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tpgs1Q99MS8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms