Protein–RNA interactions for Protein: Q99M03

Rwdd2b, RWD domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd2bQ99M03 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Rwdd2bQ99M03 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rwdd2bQ99M03 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms