Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cdk5rap3Q99LM2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdk5rap3Q99LM2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk5rap3Q99LM2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms