Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RtcbQ99LF4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RtcbQ99LF4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RtcbQ99LF4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RtcbQ99LF4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RtcbQ99LF4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RtcbQ99LF4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RtcbQ99LF4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RtcbQ99LF4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RtcbQ99LF4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RtcbQ99LF4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RtcbQ99LF4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RtcbQ99LF4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RtcbQ99LF4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RtcbQ99LF4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RtcbQ99LF4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RtcbQ99LF4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RtcbQ99LF4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RtcbQ99LF4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RtcbQ99LF4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RtcbQ99LF4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RtcbQ99LF4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RtcbQ99LF4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RtcbQ99LF4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RtcbQ99LF4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RtcbQ99LF4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RtcbQ99LF4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.7 ms