Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gps1Q99LD4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gps1Q99LD4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gps1Q99LD4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms