Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nlgn1Q99K10 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nlgn1Q99K10 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nlgn1Q99K10 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nlgn1Q99K10 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nlgn1Q99K10 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nlgn1Q99K10 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms