Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf144aQ925F3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf144aQ925F3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf144aQ925F3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms